高新技術(shù)企業(yè)認定流程主要包括以下步驟：

一、自我評價

企業(yè)應(yīng)根據(jù)《高新技術(shù)企業(yè)認定管理辦法》和《高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作指引》，對自身的知識產(chǎn)權(quán)、技術(shù)領(lǐng)域、科技人員占比、研發(fā)費用投入、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入等方面進行自我評價，初步判斷是否達到認定條件的要求。

二、注冊登記

1.國家系統(tǒng)注冊：企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”，按要求填寫《企業(yè)注冊登記表》，并通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)提交至認定機構(gòu)。認定機構(gòu)核對企業(yè)注冊信息，在網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)上確認激活后，企業(yè)方可開展后續(xù)申報工作。

2.地方系統(tǒng)注冊（如有要求）：部分地區(qū)可能有當(dāng)?shù)氐目萍紭I(yè)務(wù)管理系統(tǒng)，企業(yè)需要按照當(dāng)?shù)匾筮M行注冊登記，以便后續(xù)的申報和管理。

三、網(wǎng)上申報

企業(yè)登錄“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”，按要求填寫《高新技術(shù)企業(yè)認定申請書》，并通過網(wǎng)絡(luò)系統(tǒng)提交相關(guān)材料，包括知識產(chǎn)權(quán)相關(guān)材料、科研項目立項證明、科技成果轉(zhuǎn)化、研究開發(fā)的組織管理等。

四、提交書面材料

企業(yè)向認定機構(gòu)提交書面材料，一般包括：

《高新技術(shù)企業(yè)認定申請書》(在線打印并簽名、加蓋企業(yè)公章);

企業(yè)營業(yè)執(zhí)照等相關(guān)注冊登記證件的復(fù)印件(加蓋公章);

知識產(chǎn)權(quán)相關(guān)材料(如知識產(chǎn)權(quán)證書及反映技術(shù)水平的證明材料、參與制定標(biāo)準(zhǔn)情況等);

科研項目立項證明(省級(含計劃單列市)以上科研項目立項證明，對已驗收或結(jié)題項目需附驗收或結(jié)題報告);

科技成果轉(zhuǎn)化(總體情況與轉(zhuǎn)化形式、應(yīng)用成效的逐項說明);

研究開發(fā)組織管理(總體情況與五項指標(biāo)符合情況的具體說明);

企業(yè)高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))的關(guān)鍵技術(shù)和技術(shù)指標(biāo)的具體說明，相關(guān)的生產(chǎn)批文、認證認可和資質(zhì)證書、產(chǎn)品質(zhì)量檢驗報告等材料;

企業(yè)職工總體情況說明與科技人員名單;

經(jīng)具有資質(zhì)并符合條件的中介機構(gòu)出具的企業(yè)近三個會計年度(實際年限不足三年的按實際經(jīng)營年限)研究開發(fā)費用、近一個會計年度高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))收入專項審計或鑒證報告，并附研究開發(fā)活動說明材料;

經(jīng)具有資質(zhì)的中介機構(gòu)鑒證的企業(yè)近三個會計年度的財務(wù)會計報告(包括會計報表、會計報表附注和財務(wù)情況說明書);

近三個會計年度企業(yè)所得稅年度納稅申報表。

五、專家評審

認定機構(gòu)收到企業(yè)申報材料后，從專家?guī)熘谐槿≈辽?名評審專家(其中技術(shù)專家不少于60%，并至少有1名財務(wù)專家)組成專家組。專家對企業(yè)的申報材料進行審查，包括合規(guī)性審查、獨立評價和綜合評價等環(huán)節(jié)。審查內(nèi)容主要涉及企業(yè)的研究開發(fā)活動、知識產(chǎn)權(quán)、財務(wù)狀況、高新技術(shù)產(chǎn)品(服務(wù))等方面。具備條件的地區(qū)可進行網(wǎng)絡(luò)評審。

六、綜合評審

認定機構(gòu)根據(jù)專家組評審意見，對申請企業(yè)申報材料進行綜合評審，可視情況對部分企業(yè)進行實地核查，提出認定企業(yè)名單，報領(lǐng)導(dǎo)小組備案，報送時間一般不得晚于當(dāng)年11月底。

七、公示與備案

1.公示：經(jīng)認定報備的企業(yè)名單，由領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室在“高新技術(shù)企業(yè)認定管理工作網(wǎng)”公示10個工作日。

2.異議處理：有異議的，須以書面形式實名向領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室提出，由認定機構(gòu)核實處理。領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室也可對報備企業(yè)進行隨機抽查，對存在問題的企業(yè)交由認定機構(gòu)核實情況，提出處理建議。

八、頒發(fā)證書

公示無異議的企業(yè)，由認定機構(gòu)頒發(fā)“高新技術(shù)企業(yè)證書”(加蓋科技、財政、稅務(wù)部門公章)。